تتراوح أعراض متلازمة الشرق الأوسط التنفسية من عدم ظهور أي أعراض مرضية إلى ظهور أعراض تنفسية معتدلة تشبه أعراض البرد أو الإنفلونزا الشائعة انتقالاً إلي المرض التنفسي الحاد والوفاة.
أغلب الحالات التي تم الإبلاغ عنها كانت لديها أعراض تنفسية حادة مصحوبة بارتفاع درجة حرارة الجسم والسعال وضيق التنفس، بعض الحالات الأخرى كان لديها أعراض معوية مثل الإسهال، القيء والغثيان.